MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis RC-J/943

Total Repeats: 22955

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021896	GCC	2	6	4	9	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_021896	TGC	2	6	63	68	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_021896	ATT	2	6	75	80	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021896	CGA	2	6	97	102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_021896	TAT	2	6	239	244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021896	AG	3	6	247	252	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021896	GAA	2	6	286	291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021896	AGA	2	6	315	320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021896	AGA	2	6	369	374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021896	CAA	2	6	442	447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_021896	AATG	2	8	466	473	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021896	TTG	2	6	585	590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021896	CTC	2	6	614	619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_021896	GAT	2	6	676	681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021896	GAT	2	6	730	735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021896	GAAGGA	2	12	760	771	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021896	ATG	2	6	793	798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021896	CTAT	2	8	800	807	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_021896	CTT	2	6	1013	1018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_021896	CAG	2	6	1078	1083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_021896	A	6	6	1203	1208	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021896	AAG	2	6	1220	1225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021896	TGG	2	6	1236	1241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021896	CTT	2	6	1243	1248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_021896	T	7	7	1247	1253	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021896	A	6	6	1258	1263	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021896	AAGG	2	8	1309	1316	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021896	ATG	2	6	1336	1341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527325521
29	NC_021896	GTG	2	6	1342	1347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527325521
30	NC_021896	TCC	2	6	1351	1356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527325521
31	NC_021896	AGC	2	6	1365	1370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527325521
32	NC_021896	T	6	6	1384	1389	0 %	100 %	0 %	0 %	527325521
33	NC_021896	AGC	2	6	1392	1397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527325521
34	NC_021896	AAG	2	6	1403	1408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325521
35	NC_021896	TAC	2	6	1441	1446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527325521
36	NC_021896	GCT	2	6	1451	1456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527325521
37	NC_021896	AGTA	2	8	1489	1496	50 %	25 %	25 %	0 %	527325521
38	NC_021896	AAC	2	6	1549	1554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527325521
39	NC_021896	AGA	2	6	1561	1566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325521
40	NC_021896	TC	3	6	1598	1603	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_021896	T	6	6	1639	1644	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021896	TAA	2	6	1651	1656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021896	T	7	7	1661	1667	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021896	TC	3	6	1670	1675	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_021896	A	6	6	1733	1738	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021896	AGA	2	6	1817	1822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325522
47	NC_021896	ATC	2	6	1824	1829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527325522
48	NC_021896	TGC	2	6	1844	1849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527325522
49	NC_021896	ATGA	2	8	1893	1900	50 %	25 %	25 %	0 %	527325522
50	NC_021896	GATA	2	8	1931	1938	50 %	25 %	25 %	0 %	527325522
51	NC_021896	CAT	2	6	1968	1973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527325522
52	NC_021896	AGA	2	6	1997	2002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325522
53	NC_021896	AAG	2	6	2026	2031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325522
54	NC_021896	GGA	2	6	2061	2066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527325522
55	NC_021896	AG	3	6	2153	2158	50 %	0 %	50 %	0 %	527325523
56	NC_021896	ATC	2	6	2190	2195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527325523
57	NC_021896	TC	3	6	2234	2239	0 %	50 %	0 %	50 %	527325523
58	NC_021896	ATA	2	6	2340	2345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527325523
59	NC_021896	AAC	2	6	2365	2370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527325523
60	NC_021896	GGT	2	6	2419	2424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527325523
61	NC_021896	AAT	2	6	2525	2530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527325523
62	NC_021896	TTC	2	6	2560	2565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325523
63	NC_021896	GCA	2	6	2579	2584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527325523
64	NC_021896	GGA	2	6	2627	2632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527325523
65	NC_021896	CAG	2	6	2646	2651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527325523
66	NC_021896	GTT	2	6	2663	2668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527325523
67	NC_021896	GGT	2	6	2755	2760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527325523
68	NC_021896	GA	3	6	2821	2826	50 %	0 %	50 %	0 %	527325523
69	NC_021896	T	6	6	2828	2833	0 %	100 %	0 %	0 %	527325523
70	NC_021896	AAG	2	6	2913	2918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325523
71	NC_021896	ATT	2	6	2975	2980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527325523
72	NC_021896	TTG	2	6	3027	3032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527325523
73	NC_021896	CATG	2	8	3109	3116	25 %	25 %	25 %	25 %	527325523
74	NC_021896	AAG	2	6	3138	3143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325523
75	NC_021896	AAG	2	6	3153	3158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325523
76	NC_021896	CAG	2	6	3195	3200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527325523
77	NC_021896	GCT	2	6	3266	3271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527325523
78	NC_021896	TGTGA	2	10	3281	3290	20 %	40 %	40 %	0 %	527325523
79	NC_021896	TTCC	2	8	3414	3421	0 %	50 %	0 %	50 %	527325523
80	NC_021896	AAG	2	6	3432	3437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325523
81	NC_021896	CAG	2	6	3482	3487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527325523
82	NC_021896	GGA	2	6	3569	3574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527325523
83	NC_021896	AAT	2	6	3579	3584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527325523
84	NC_021896	TTGAA	2	10	3637	3646	40 %	40 %	20 %	0 %	527325524
85	NC_021896	ATT	2	6	3659	3664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527325524
86	NC_021896	TGA	2	6	3689	3694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527325524
87	NC_021896	TTTA	2	8	3812	3819	25 %	75 %	0 %	0 %	527325524
88	NC_021896	GTA	2	6	3921	3926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527325524
89	NC_021896	GAGAA	2	10	3931	3940	60 %	0 %	40 %	0 %	527325524
90	NC_021896	AGA	2	6	3968	3973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325524
91	NC_021896	ATCC	2	8	4112	4119	25 %	25 %	0 %	50 %	527325524
92	NC_021896	GAA	2	6	4152	4157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325524
93	NC_021896	CGT	2	6	4284	4289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527325524
94	NC_021896	A	7	7	4328	4334	100 %	0 %	0 %	0 %	527325524
95	NC_021896	GTT	2	6	4335	4340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527325524
96	NC_021896	GAAAA	2	10	4368	4377	80 %	0 %	20 %	0 %	527325524
97	NC_021896	A	7	7	4374	4380	100 %	0 %	0 %	0 %	527325524
98	NC_021896	TGA	2	6	4472	4477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527325524
99	NC_021896	AT	3	6	4514	4519	50 %	50 %	0 %	0 %	527325524
100	NC_021896	TTACA	2	10	4523	4532	40 %	40 %	0 %	20 %	527325524
101	NC_021896	TTG	2	6	4567	4572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527325524
102	NC_021896	TTC	2	6	4708	4713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325524
103	NC_021896	TCT	2	6	4800	4805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325524
104	NC_021896	AGA	2	6	4820	4825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325524
105	NC_021896	GTT	2	6	4847	4852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527325524
106	NC_021896	GACG	2	8	4859	4866	25 %	0 %	50 %	25 %	527325524
107	NC_021896	GGT	2	6	4895	4900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527325524
108	NC_021896	AAAGCT	2	12	4941	4952	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	527325524
109	NC_021896	TTGG	2	8	4962	4969	0 %	50 %	50 %	0 %	527325524
110	NC_021896	CTC	2	6	4999	5004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527325524
111	NC_021896	AGC	2	6	5030	5035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527325524
112	NC_021896	GCA	2	6	5055	5060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_021896	A	6	6	5066	5071	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021896	AGA	2	6	5082	5087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021896	ATT	2	6	5149	5154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527325525
116	NC_021896	TCT	2	6	5167	5172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325525
117	NC_021896	GCT	2	6	5213	5218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527325525
118	NC_021896	GTCTT	2	10	5219	5228	0 %	60 %	20 %	20 %	527325525
119	NC_021896	GAT	2	6	5248	5253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527325525
120	NC_021896	TC	3	6	5264	5269	0 %	50 %	0 %	50 %	527325525
121	NC_021896	GA	3	6	5275	5280	50 %	0 %	50 %	0 %	527325525
122	NC_021896	ACG	2	6	5286	5291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527325525
123	NC_021896	GAA	2	6	5310	5315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325525
124	NC_021896	TGGA	2	8	5323	5330	25 %	25 %	50 %	0 %	527325525
125	NC_021896	AT	3	6	5379	5384	50 %	50 %	0 %	0 %	527325525
126	NC_021896	AGA	3	9	5387	5395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325525
127	NC_021896	GCT	2	6	5396	5401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527325525
128	NC_021896	AGA	2	6	5405	5410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325525
129	NC_021896	TGG	2	6	5441	5446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527325525
130	NC_021896	AGA	3	9	5459	5467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325525
131	NC_021896	GGA	2	6	5468	5473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527325525
132	NC_021896	TG	3	6	5532	5537	0 %	50 %	50 %	0 %	527325525
133	NC_021896	TA	3	6	5603	5608	50 %	50 %	0 %	0 %	527325525
134	NC_021896	T	6	6	5610	5615	0 %	100 %	0 %	0 %	527325525
135	NC_021896	TCA	2	6	5653	5658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527325525
136	NC_021896	GGA	2	6	5690	5695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527325525
137	NC_021896	CTTT	2	8	5700	5707	0 %	75 %	0 %	25 %	527325525
138	NC_021896	CTT	2	6	5750	5755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325525
139	NC_021896	CTG	2	6	5756	5761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527325525
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270	NC_021896	TA	3	6	11872	11877	50 %	50 %	0 %	0 %	527325531
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